Исследователи обнаружили связь между противовирусным препаратом молнупиравиром и специфическими мутациями вируса SARS-CoV-2. Хотя моленпиравир используется для индукции мутаций, ослабляющих вирус, исследования выявили различные закономерности мутаций у людей, принимавших препарат. Эти варианты особенно распространены среди пожилых людей и в регионах, где используется больше моногравира.

Исследование выявило связь между противовирусным препаратом моногравиром и различными вариантами SARS-CoV-2, что подчеркивает необходимость тщательной оценки во время разработки лекарства.

Исследователи из Института Фрэнсиса Крика, Кембриджского университета, Имперского колледжа Лондона, Ливерпульского университета, Кейптаунского университета и Агентства безопасности здравоохранения Великобритании (UKHSA) обнаружили связь между противовирусным препаратом молнупиравиром, используемым для лечения инфекций COVID-19, и характером мутаций вируса SARS-CoV-2.

Принцип действия моногравира заключается в индуцировании мутаций в генетической информации или геноме вируса в процессе репликации вируса. Многие из этих мутаций уничтожают или убивают вирус, тем самым снижая вирусную нагрузку в организме. Это был один из первых противовирусных препаратов, появившийся на рынке во время пандемии COVID-19, и он получил широкое распространение во многих странах.

В исследовании, опубликованном сегодня (25 сентября) в журнале Nature, ученые использовали глобальные базы данных секвенирования для картирования мутаций вируса SARS-CoV-2 с течением времени. Они проанализировали генеалогическое древо, состоящее из 15 миллионов вирусных последовательностей SARS-CoV-2, что позволило им увидеть, какие мутации произошли на каждом этапе эволюционной истории каждого вируса.

Необычные закономерности мутаций

Хотя вирус постоянно мутирует, исследователи в глобальных базах данных секвенирования обнаружили события мутаций, которые полностью отличаются от типичных моделей мутаций COVID-19, и эти события мутаций тесно связаны с людьми, принимавшими моренпивир.

Эти мутации усилились в 2022 году, что совпало с появлением моногравира. Эти мутации также с большей вероятностью появляются у пожилых людей, что согласуется с использованием противовирусных препаратов для лечения групп высокого риска и со странами, которые, как известно, имеют более высокие показатели использования молнупиравира. В Великобритании исследователи проанализировали данные лечения и обнаружили, что по меньшей мере 30% событий были связаны с применением моногравира.

Сравнение глобальной базы данных секвенирования с известными наборами данных пациентов, получавших моногравир, выявило идентичные паттерны мутаций (мутации C на T и G на A). Изображение предоставлено: Тео Сандерсон, Природа (2023).

Причину события мутации можно отследить, наблюдая за его «сигнатурой мутации»: предпочтением мутаций в определенных последовательностях генома. Исследователи обнаружили, что характеристики, возникающие в результате этих мутационных событий, близко соответствуют характеристикам, наблюдаемым в клинических испытаниях молнупиравира.

Исследователи также обнаружили несколько небольших групп вариантов, что позволяет предположить, что вариант может передаваться от одного человека к другому, хотя не было обнаружено никаких вызывающих беспокойство вариантов, связанных с этим признаком.

Влияние и экспертные мнения

Трудно понять влияние лечения молнупиравиром на риск появления новых вариантов и любое влияние, которое оно может оказать на общественное здравоохранение. Также важно учитывать, что хроническая инфекция COVID-19, для лечения которой используется молнупиравир, сама по себе может привести к появлению новых вариантов.

«COVID-19 по-прежнему оказывает серьезное влияние на здоровье человека, и некоторым людям трудно избавиться от вируса, поэтому мы должны разработать лекарства, направленные на сокращение продолжительности инфекции», — сказал Тео Сандерсон, первый автор статьи и постдокторант из Института Фрэнсиса Крика. «Но наши данные показывают, что один конкретный противовирусный препарат — молнупиравир — также может вызывать новые мутации и увеличивать генетическое разнообразие выжившей популяции вируса».

«Наши результаты способствуют постоянной оценке рисков и преимуществ лечения молнупиравиром. Возможность сохранения противовирусных вариантов необходимо принимать во внимание при разработке новых лекарств, которые действуют аналогичным образом. Наша работа показывает, что беспрецедентный масштаб наборов данных о постпандемических последовательностях, созданных совместно тысячами исследователей и медицинских работников по всему миру, обладает огромной силой, позволяющей раскрыть истины об эволюции вируса, которые были бы невозможны при анализе данных из какой-либо одной страны».

Кристофер Руис с медицинского факультета Кембриджского университета сказал: «Моноравир — один из ряда препаратов, используемых для борьбы с COVID-19. Он принадлежит к классу препаратов, которые могут вызвать сильную мутацию вируса, что приводит к его фатальному ослаблению. Но мы обнаружили, что у некоторых пациентов этот процесс не уничтожил весь вирус, и некоторые мутировавшие вирусы распространились. Это необходимо учитывать при оценке общих преимуществ и рисков молнупиравира и аналогичных препаратов».