Новая статья, опубликованная издательством Оксфордского университета в журнале «Молекулярная биология и эволюция», представляет собой первый полный источник генома панголина, также известного как чешуйчатый муравьед. Панголины обитают в Азии и Африке к югу от Сахары и являются единственными млекопитающими, покрытыми чешуей. Животные, которых продают в больших количествах ради мяса и предполагаемых лечебных свойств, также находятся на грани исчезновения из-за повсеместной вырубки лесов в их естественной среде обитания.
Панголины, состоящие из восьми существующих видов, в последние годы привлекли большое внимание общественности, и усилия по их сохранению продолжаются. Во многом это связано с тем, что панголины являются наиболее продаваемыми дикими млекопитающими на планете, и недавно было высказано предположение, что они могут быть связаны с пандемией COVID-19 (что, конечно, неверно).
Значение геномики панголинов
Несмотря на критическую ситуацию с сохранением панголинов, они все еще недостаточно изучены, и все еще существуют большие пробелы в основных исследованиях видов или популяций. Исследователи теперь уделяют все больше внимания геномике при изучении дикой природы, поскольку геномика предоставляет данные, которые могут более точно понять разделение видов или популяций, информацию о популяциях, разнообразии, исторических траекториях и способности животных адаптироваться к глобальным изменениям. Не говоря уже о его потенциале для отслеживания происхождения лиц, незаконно продаваемых людьми, чтобы лучше выявлять горячие точки браконьерства и разрушать сети торговли людьми.
Недавняя статья, опубликованная в журнале «Молекулярная биология и эволюция», представляет собой обширную базу данных геномов панголинов, что имеет решающее значение для их сохранения. Панголины являются наиболее продаваемыми дикими млекопитающими в мире. Они обитают в Азии и Африке и сталкиваются с постоянной угрозой охоты и разрушения среды обитания. Это исследование, в ходе которого панголины исторически были недостаточно изучены, заполняет серьезный пробел путем секвенирования нескольких видов панголинов и даже идентифицирует потенциальный новый вид. Источник изображения: Даррен Питерсен/"Молекулярная биология и эволюция"
Проблемы, стоящие перед исследованием генома панголинов
Получение полногеномной информации о панголинах является сложной задачей. Во-первых, географическая изоляция видов панголинов и ограниченная летопись окаменелостей создают методологические препятствия. Виды панголинов в Азии и Африке разошлись примерно 37,9 миллионов лет назад, поэтому трудно по-настоящему понять эволюцию групп панголинов, используя эталонные геномы далеких видов. Во-вторых, неуловимое поведение панголинов и их распространение в тропиках делают генетический отбор дорогостоящим и отнимающим много времени.
Результаты и значимость исследования
Исследователи секвенировали, собрали и аннотировали первый эталонный геном гигантского панголина, обитающего в Африке, а также геномы чернобрюхого панголина, южноафриканского панголина, индийского панголина и филиппинского панголина. Эти новые геномные данные, наряду с ранее опубликованной информацией об остальных трех видах — белобрюхом панголине, панголине Сунда и китайском панголине — предоставляют первый полный геном панголина. В процессе исследователи также обнаружили потенциальный новый вид панголинов на основе ранее опубликованных геномных данных.
Исследователи полагают, что эта информация в конечном итоге предоставит полную картину того, как панголины развиваются с течением времени в ответ на изменяющиеся условия окружающей среды, а также предоставит важную информацию о том, как эффективно защитить этих животных посредством приоритетов сохранения и планов управления на ближайшие годы. Результаты также помогут разработать наборы инструментов ДНК для отслеживания торговли панголинами.
Шон Хайтон, один из авторов статьи, сказал: «Совместный подход авторов этого исследования, приехавших из Африки, Азии и Европы, позволяет нам впервые углубиться в эволюцию панголинов всех восьми видов с точки зрения всего генома. Мы надеемся, что эти геномы станут основой для дальнейших генетических исследований, которые помогут защитить этих животных».